Michael Garrett Shanks est né le 15 décembre 1970, à Vancouver, Canada. Il a grandi en Colombie Britannique. C’est en se baladant sur la plage, à l’age de 19 ans, qu’il voit Richard Dean Anderson jouer une scène de MacGyver, et qu’il trouve sa vocation : la comédie. Pendant 2 ans, il va parcourir l’Ontario avec sa troupe.

Après plusieurs petits rôles, il entre, en 1997, dans la série Stargate Sg-1 pour jouer le Docteur Daniel Jackson.

Michael a été marié avec Vaitiare Bandera (Sha’re dans SG1) et ils eurent une fille ensemble en 1998. Il s’est remarié, il y a peu de temps à Lexa Doig (Andromeda/Rommie dans Andromeda). Elle joue également le rôle de Carolyn Lam dans SG1. De cette union est née une fille, « Mia Tabitha » en septembre 2004 et un fils, « Samuel David » en mars 2006.