Ecrit par Martin Gero, Harmony, placé en 17ème position dans l'ordre de diffusion, marquera le retour d'un peuple assez inamical envers l'expédition: les Genii.

Flora et Mardola divertissent Sheppard et McKay dans la salle royale d'audience afin ed célébrer l'alliance formée par leur deux sociétés. Selon les termes de l'accord, l'expédition d'Atlantis assurera une protection contre les Wraiths en échange de nourriture.

Conformément aux coutumes, la princesse, Harmony, doit se rendre aux ruines du Grand Temple, situé au coeur de la foret, afin de méditer et prier. Cette opération ne prend qu'une journée, mais par mesure de précaution, Flora et Mardola demandent à John et Rodney de l'accompagner. Selon elles, ceci est en parfait accord avec les traditions encadrant ce rituel.

Très rapidement, John et Rodney vont découvrir la présence de soldats Genii sur cette planète, et ne vont pas hésiter à réduire leur nombre. Mais un mystère entoure leur présence, et surtout quel but poursuivent-ils en essayant de tuer Harmony?