Peter Williams est né à Kingston en Jamaïque mais il vit aujourd'hui avec sa famille au Canada. Il est le frère de Stephen Williams, producteur de la série Lost.
Il sort de l'université avec un diplôme d'Art en géographie et archéologie et a étudié à l'Université de Nottingham en Angleterre. Il commence sa carrière d'acteur en 1982 et va enchaîner de nombreuses séries (MacGyver, Neon rider, X-Files, Da Vinci's Inquest) et des films comme Les Chroniques de Riddick ou Catwoman. Il interprète le rôle d'Apophis durant 20 épisodes entre 1997 et 2005. Après Stargate, il continue d'avoir de nombreux projets comme la série Fallen.