Ecrit par Martin Gero, The Lost Tribe sera le onzième épisode de la saison 5 de Stargate Atlantis. Cet épisode s'inscrit dans la suite des événements de l'épisode de mi-saison First Contact.
Voici donc les premières informations disponibles.

Les membres de l'équipe de Sheppard se retrouvent dispersés un peu partout dans la galaxie.

Mckay et Daniel Jackson se retrouvent dans un entrepôt appartenant à Janus. Là, ils ont fait la rencontre d'un Asgard qui a pour but d'éliminer les Wraiths de la galaxie. Ce dernier active un appareil malgré les oppositions de Daniel. L'Asgard sait que son espèce se meurt, et estime qu'ils ne leur restent pas assez de temps pour travailler sur une autre option.

De son côté, Todd a pris le contrôle de l'Apollo, où sont présents Ronon, Keller, Woolsey et le Major Marks. Dans la bataille, l'appareil a subi de sérieux dégâts. Malgré les efforts de Todd, certains membres d'équipage du vaisseau ont réussi à s'évader. Ne tolérant pas cette situation, Todd lance un ultimatum: si les personnes évadées ne se rendent pas il exécutera ses prisonniers. Todd est très préoccupé par un appareil, et décide de faire route vers l'endroit où se trouve Daniel et Rodney pour le retrouver.

Sheppard et Zelenka se trouvent eux à bord d'un vaisseau des Travelers commandé par Katana. Radek et Mila, la chef ingénieure de l'appareil, travaille d'arrache pied pour rejoindre l'entrepôt de Janus avant l'Apollo. John pense que si Todd y arrive en premier, il tuera Rodney et Daniel. Ils essaient de tirer partie de la puissance de l'hyperpropulsion du vaisseau, mais les systèmes fonctionnent à peine car ils sont composés de pièces de récupération. Experte dans le domaine de l'hyperpropulsion, Mila est très confiante dans son appareil, au contraire de Zelenka.

Qui arrivera en premier à l'entrepôt, et surtout qui sruvivra à la bataille qui s'annonce?