apres plusieur video je pense que  le  phoenix n'est pas different d'un 304 normal  (sauf  le core asgard en plus et  peut etre un avant un peu plus large  , mais toujour les 2 hangard  , la meme morphologie generale )
sinon il y au moins 2 explosions :
- l'une est celle d'un vaisseau ruche car on voit facilement sa forme habituelle de  plus on voit en arriere plan un autre vaisseau ruche et celui ci ne tire pas sur le vaisseaux qui explose mais sur un autre qui n'est pas visible (donc ==>ruche )
-la seconde  explosion est plus difficile a dechifre mais je penche pour une seconde ruche
car a travers l'explosion on apercois des " elements" (morceaux du vaisseau )  assez "long"  caracteristique des vaisseaux ruche 
enfin pour l'ocean qui devient un desert , 40 000 ans c'est trop rapide sauf si un element a fait augmente l'activite / taille du soleil  augmentant la temperature de la planete au point de faire disparaitre les oceans  elemnt introduit par erreur ou par un enemies (solution un peu folle  

  )
il est possible que atlantis ait quitte la planete (attaque par les wraith) puis atteri en catastrophe sur une planete deserte et en 40 000 ans  a ete recouverte  par le sable(solution plus realiste )
une petite image explique :
desole pour la mauvaise qualite de l'image
edit: regarder la video et comparer la taille du vaisseau qui explose avec la ruche  : elle sont tres proche  or  un 304 est beacoup plus petit qu'une ruche